mAb : génération et ingénierie

mAb : génération et ingénierie

Créer le bon format d’anticorps


A partir d’un antigène donné, MImAbs produit, sélectionne et optimise les anticorps pour mieux les adapter à l’application prévue.

À partir de différents antigènes (cellules, protéines recombinantes, peptides, ARNm, etc.), MImAbs produit rapidement et examine automatiquement plusieurs dixaines de milliers de cellules B uniques (jusqu'à 11 000 cellules par puces) avec la plateforme Optofluidic Beacon® (Bruker Cellular Analysis).

 

Immunisation

  • De souris (BALB/c, C57Bl/6 et modèles KO)ou des souris humanisées ATX-Gx™ (fournisseur certifié des modèles ATX-Gx™d'Alloy-Therapeutics) avec des injections répétées.
  • Contrôlée via une titration sérique par ELISA ou FACS.

 

Etapes sur le Beacon®

  • Jusqu'à 40 000 plasmocytes (11 000 cellules B uniques par puce) provenant de rate ou de moelle osseuse, ensemencés dans des chambres NanoPen™ et criblés par campagnes Beacon®.
  • Criblage fonctionnel rapide sur puce au niveau de la cellule unique avec un antigène recombinant ou un transfectant exprimant l'antigène.
  • Un large choix de critères de sélection pour le criblage Beacon® : reconnaissance de l'antigène, activité de blocage, propriétés de réactivité croisée.
  • Exportation des hits d'intérêt et séquençage.
  • Présélection des hits par analyse et modélisation in sillico des séquences : points de fragilité des CDR, patchs des CDR, etc.

 

MImAbs a développé une collection de vecteurs adaptables pour la production de différents formats (Fc compétent ou Fc silencieux, ingénierie des cystéines, fragments d'anticorps, formats bispécifiques ou multispécifiques). Ils peuvent être utilisés pour cloner les anticorps produits par MImAbs durant les campagnes Beacon® ou les séquences fournies par les clients.

Les processus de clonage ont été complètement automatisés grâce aux robots Tecan EVO200 et FLUENT 780 afin d’assurer un processus haut débit, rapide et performant.

 

Choix du format de l’anticorps

MImAbs peut produire des anticorps humains et de souris en différents formats standards ou personnalisés (IgG, Fab, Fab’, Fab’2…). Différents formats peuvent être envisagés ; ceux qui sont prêts et disponibles immédiatement incluent :

Reference

Antibody format

Description

Purpose

GD

Mouse IgG1

Heavy chain mutation:

D265A

Fc silent, deglycosylated antibody

GE

Human IgG1

Heavy chain mutation:

E345K

mAb multimerization

GH

Human hybrid

CH1 (IgG2)

CH2-CH3 (IgG1)

Heavy chain mutation:

C219S

Enhanced mAb internalisation

M1

Human IgG1

Heavy chain mutations:

L235V, F243L, R292P,

Y300L, P396L

Enhanced ADCC response

S1

Human IgG1

Heavy chain mutation:

N297S

Deglycosylated antibody

2 BTG coupling sites

S2

Human or mouse IgG1

Heavy chain mutation:

N297Q

Deglycosylated antibody

4 BTG coupling sites

V1

Human IgG1

Heavy chain mutations:

E233D, G237D, P238D,

H268D, P271G, A330R

Enhanced binding to the Fc-g-RIIB receptor

 

Production d'anticorps

MImAbs produit des anticorps de la micro-échelle (100 µg) jusqu'à plusieurs centaines de milligrammes, en fonction de leur utilisation.

  • Production et purification à micro-échelle (100 µg) pour la détermination de l'EC50, en particulier pour les hits sélectionnés par Beacon® (jusqu'à 100 hits).
  • Production et purification à l'échelle du milligramme pour les essais in vitro / fonctionnels.
  • Production et purification à plus grande échelle (plusieurs centaines de mg jusqu'au gramme) pour des études pharmacologiques in vivo ou de toxicité.

L’humanisation est importante afin d’empêcher une réaction immunitaire contre les anticorps de rongeurs chez les patients. MImAbs opère par greffe du CDR en suivant trois étapes clés :

 

Détermination de la séquence humaine la plus proche

Les séquences de gènes d’immunoglobuline VH et VL humains sont analysées à l’aide de deux outils in silico: IMGT et IGBLAST. Les immunoglobulines qui sont phylogénétiquement les plus proches de l’anticorps du rongeur parent sont utilisées comme « framework » pour l’anticorps humanisé (FR).

 

Définition des CDR

Les trois régions déterminant la complémentarité des domaines variables (CDRs) sont définies en suivant les systèmes de nomenclature de Kabat et IMGT, et sont introduites dans la séquence FR humaine.

 

Backmutations

Des résidus supplémentaires provenant de l’anticorps murin sont réintroduits dans la séquence FR humaine afin de préserver la structure de l’anticorps et la spécificité de l’antigène :

  • Les résidus responsables de l’ancrage du CDR

  • Les résidus de la zone Vernier qui sont directement sous les CDRs et qui sont importants pour maintenir la confomration des CDRs3

  • Les résidus impliqués dans l’intéraction entre les chaînes lourdes et légères

Le résultat du processus d’humanisation consiste en 9 à 16 versions humanisées de l’anticorps contenant des backmoutations dans les chaînes VH et VL et pouvant être testées pour leur liaison et leur spécificité envers l’antigène.

 

1 Kabat EA et al, NIH Publication 1991

2 Lefranc MP et al, Dev Comp Immunol 2003

3 Foote et Winter, J Mol Biol 1992